[EDIT: J'ai eu un soucis à la première utilisation, j'ai du lancer fsck pour corriger certains petits problèmes. Il y a surement moyen de faire mieux.]

J'utilise pv ( http://linux.die.net/man/1/pv ) pour avoir une idée de l'état d'avancement et gzip pour diminuer un peu la place que prend le backup sur le disque :

Pour repérer la carte SD à sauvegarder :
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$ sudo fdisk -l
(...)
Device Boot Start End Sectors Size Id Type
/dev/sdh1 8192 131071 122880 60M c W95 FAT32 (LBA)
/dev/sdh2 131072 15523839 15392768 7,3G 83 Linux
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Il faut démonter les partitions :
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$ sudo umount /dev/sdh1
$ sudo umount /dev/sdh2
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Pour faire le backup :
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$ sudo dd if=/dev/sdh | gzip -v6 | pv | dd of=/media/hd2/rpi/bkp-20160210.gz
196MiO 0:02:36 [ 900KiB/s] [ <=> ]
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Pour le restaurer :
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$ zcat /media/hd2/rpi/bkp-20160210.gz | pv | sudo dd of=/dev/sdh
73MiO 0:00:50 [ 851KiB/s] [ <=> ]
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Attention à bien vérifier que la carte SD est sur /dev/sdh ! (et pas sdb ou autre!) Un petit "fdisk -l" permet de s'en assurer.